El organigrama y las funciones de la EVES vienen regulados en la Orden 3/2022, de 22 de abril, de la Conselleria de Sanidad Universal y Salud Pública que desarrolla el  Decreto 185/2020, de 16 de noviembre, del Consell, de aprobación del Reglamento orgánico y funcional de la Conselleria de Sanitat Universal i Salut Pública.
En la Sección II. Unidades administrativas de la Dirección General de Recursos Humanos, Artículo 33. Subdirección General de la Escuela Valenciana de Estudios de la Salud, se establece su organización y competencias. 
Su estructura es la siguiente:
Dirección General de la EVES, Servicio de Gestión Administrativa y Servicio de Docencia
(Orden 3/2022, de 22 de abril, de la Conselleria de Sanidad Universal y Salud Pública)
 

Normativa: Reglamento Orgáncio Funcional, resolución junio 2018